Ban Quản lý Khu kinh tế tỉnh Lào Cai được thành lập tại Quyết định số 317/QĐ-TTg ngày 4/3/2014 của Thủ tướng chính phủ trên cơ sở sáp nhập Ban quản lý các cửa khẩu và Ban quản lý các Khu công nghiệp tỉnh Lào Cai.
